Walaupun kedua-dua isopropanol dan etanol isopropanol terdiri daripada karbon, hidrogen, dan oksigen, struktur molekulnya berbeza. Isopropanol mempunyai formula molekul CH3CH2CH2OH, menjadikannya sebatian organik tiga-karbon tepu, manakala isopropanol etanol mempunyai formula molekul (CH3)2CHOH, menjadikannya sebatian organik yang mengandungi satu atom karbon kiral.
Takat didih berbeza: Isopropanol mendidih pada 97.2 darjah, manakala isopropanol etanol mendidih pada 82.4 darjah. Pada suhu bilik, isopropanol ialah cecair tidak berwarna, lutsinar, manakala etanol ialah cecair kuning pucat.
Keterlarutan berbeza: Oleh kerana struktur molekulnya yang berbeza, isopropanol dan etanol adalah berbeza larut. Isopropanol mempunyai keterlarutan 10.6% (mengikut isipadu) dalam air, manakala isopropanol etanol mempunyai keterlarutan yang lebih tinggi, mencapai 50% (mengikut isipadu).
Keasidan/Keseimbangan: Kedua-dua isopropanol dan etanol adalah alkohol, mempunyai keasidan sederhana dan mampu menjalani-tindak balas bermangkin.
